基因關聯分析的修正方法及修正裝置

Submitted by Anonymous (not verified) on Wed, 02/05/2020 - 15:05
基因關聯分析

專利權:清華大學

作者:索津莉;鮑峰;戴瓊海;

?

一:權力要求書

1.一種基因關聯分析的修正方法,其特征在于,包括以下步驟:

獲取序列步驟:根據訓練的隱馬爾可夫模型學習到的生成概率分布獲取新的樣本的基因序列;

生成樣本步驟:根據所述新的樣本的基因序列生成新的樣本;

標簽賦值步驟:對所述新的樣本進行標簽賦值,其中,將所述新的樣本與預設的患病以及健康的樣本進行對比,以確定所屬類別并放棄或者保留;以及似然比檢驗步驟:重復執行所述獲取序列步驟、生成樣本步驟和所述標簽賦值步驟,以得到滿足預設條件的多個樣本,并獲取新的數據集,以進行基于回歸方程的似然比檢驗。

2.根據權力要求1所述的基因關聯分析的修正方法,其特征在于,所述訓練的隱馬爾可夫模型的訓練方法包括:

檢測基因核苷酸多態性位點(snp)si上游下游位置的L個snp;

根據所述L個snp得到基因集合Si(n);

在所述基因集合si(n)上,通過隱馬爾科夫模型對序列進行建模,并通過訓練所述隱馬爾科夫模型到生成模型的參數集Θ,以得到所述訓練的隱馬爾可夫模型。

3.根據權力要求2所述的基因關聯分析的修正方法,其特征在于,所述得到所述訓練的隱馬爾科夫模型,進一步包括:

通過最大化所述參數集

冯仰妍破处门